人肿瘤circRNA PCR芯片


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    PCR ARRAY介绍

    PCR ARRAY又称PCR芯片,运用高通量荧光定量PCR方法,在一张96孔或384孔板上同时对某个信号通路或疾病相关基因的表达量变化进行检测,芯片上的基因包括了与研究对象有确定关系的基因或者待考证的基因;目前启因生物针对不同的信号通路和疾病相关基因设计了150多款功能分类PCR芯片,涵盖生命科学研究的各个领域。

    人肿瘤circRNA PCR芯片介绍

        circRNA 与肿瘤 TNM 分型密切相关。circRNA 通过调控大量信号通路与肿瘤细胞的增殖、凋亡以及转移密切关联,另外还能通过细胞外囊泡(e.g. 外泌体,纳米微粒)进行转运,并且circRNA 具有低分子量、较好的稳定性与保守性的特点,因此,circRNA 具有作为治疗肿瘤的药物靶点或载体的潜能。启因生物的人肿瘤circRNA PCR ARRAY含有94个人肿瘤circRNA 相关基因,包含乳腺癌,食管癌,非小细胞肺癌,肝癌,胃癌,膀胱癌,骨肉瘤,胶质瘤等数十种肿瘤或癌症类型。

    产品说明

    产品名称

    肿瘤circRNA PCR芯片

    货    号

    sp-TWCPAHM-0012

    基因数目

    94

    基因名称

    见基因列表

    检测费用

    1000/

    样本类型

    细胞,组织等

    项目周期

    2周(不含节假日)

    实验结果

    原始数据,数据分析

    技术原理

    *相对定量,SYBR Green

    *相对定量:用于测定一个测试样本中目标基因与校正样本中同一基因表达的相对变化。校正样本可以是一个未经处理的对照或者是在一个实验研究中处于零时的样本

    服务特点

    1. 只需提供样品

    2. 数据分析多样性选择

    3. 中低通量,一次性检测多个相关基因的表达水平

    4. 周期短

    5. 结果不需要qPCR验证

    服务流程

    1. 确定实验方案,签合同

    2. 样品寄出(-80℃顺丰寄出)

    3. 收样后进行质控

    4. 质控过关,上机检测

    5. 数据分析

    样品预处理方法

    为了避免样品中RNA降解,需对样品进行预处理。

    样品类型

    处理方法

    送样量

    贴壁细胞

    倒出培养液,用 1×PBS 清洗一次。
    10 cm2生长的培养细胞中加入 1-2 ml trizol,轻微晃动,确保使裂解液均匀分布于细胞表面。将内含细胞的裂解液转移至离心管中-80℃保存

    至少1×106个细胞

    悬浮细胞

    将悬浮培养细胞连同培养液一起倒入离心管中,8,000 g 4℃离心2 分钟,弃上清。
    向细胞中加入 1 ml trizol-80℃保存

    至少1×106个细胞

    组织(动物器官类)

    离心管中加1 ml trizol,确保浸没组织,-80℃保存

    至少20mg,约小黄豆大小

     

    检测流程:

    1. 样品总RNA提取

    2. RNA质量检测,检测RNA纯度及完整度,提供RNA质量报告;

    3. cDNA合成,使用逆转录酶,将样品RNA逆转录为cDNA

    4. 实时定量PCR反应;

    5. 数据分析,计算PCR芯片中的各个Ct值,采用ΔΔCt方法比较基因的表达变化,并利用公司自主开发的数据分析软件进行比较。

     

    基因列表 

    hsa_circ_0001445

    hsa_circ_0001189

    hsa_circ_0003222

    hsa_circ_0001283

    hsa_circ_0002111

    hsa_circ_0002260

    hsa_circ_0003707

    hsa_circ_0001824

    hsa_circ_0004458

    hsa_circ_0024108

    hsa_circ_0006022

    hsa_circ_0001875

    hsa_circ_0004771

    hsa_circ_0036722

    hsa_circ_0006633

    hsa_circ_0004619

    hsa_circ_0015278

    hsa_circ_0058106

    hsa_circ_0014717

    hsa_circ_0006054

    hsa_circ_0021553

    hsa_circ_0058107

    hsa_circ_0047905

    hsa_circ_0006528

    hsa_circ_0064557

    hsa_circ_0007874

    hsa_circ_0054971

    hsa_circ_0008717

    hsa_circ_0067103

    hsa_circ_0000130

    hsa_circ_0057104

    hsa_circ_0008945

    hsa_circ_0078738

    hsa_circ_0000497

    hsa_circ_0058766

    hsa_circ_0018293

    hsa_circ_0079891

    hsa_circ_0001649

    hsa_circ_0060108

    hsa_circ_0005273

    hsa_circ_0016347

    hsa_circ_0001727

    hsa_circ_0063561

    hsa_circ_0007158

    hsa_circ_0013339

    hsa_circ_0003570

    hsa_circ_0069131

    hsa_circ_0041103

    hsa_circ_0000284

    hsa_circ_0004018

    hsa_circ_0081146

    hsa_circ_0061265

    hsa_circ_0023404

    hsa_circ_0005075

    hsa_circ_0084720

    hsa_circ_0082582

    hsa_circ_0013958

    hsa_circ_0005986

    hsa_circ_0085553

    hsa_circ_0002768

    hsa_circ_0003028

    hsa_circ_0000594

    hsa_circ_0089548

    hsa_circ_0075825

    hsa_circ_0007915

    hsa_circ_0004383

    hsa_circ_0091742

    hsa_circ_0075828

    hsa_circ_0013255

    hsa_circ_0000026

    hsa_circ_0138960

    hsa_circ_0075829

    hsa_circ_0054345

    hsa_circ_0000140

    hsa_circ_0000069

    hsa_circ_0004136

    hsa_circ_0061893

    hsa_circ_0000181

    hsa_circ_0020397

    hsa_circ_0017446

    hsa_circ_0070963

    hsa_circ_0000190

    hsa_circ_0000098

    hsa_circ_0035381

    hsa_circ_0071410

    hsa_circ_0000745

    hsa_circ_0000732

    hsa_circ_0058058

    hsa_circ_0072088

    hsa_circ_0001895

    hsa_circ_0000893

     

    hsa_circ_0072765

    hsa_circ_0003159

    hsa_circ_0000911

     

     

    更多芯片基因列表可上www.pcrarray.cn查询

     

    参考文献

    Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)

    Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)

    Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.IF6.065

    公司地址:

    城北路1355号上海大学科技园A901

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  • 实验管理
  • 2019-03-29
  • 医学检验