一些人认为：如果DCM中含有10％以上的MeOH，很大概率会溶解部分硅胶，从而在试管中形成大量无定形白色固体——硅胶，做核磁也可以看到在0-0.5 ppm有很明显的峰。

国外有人做了一个试验，将1g的Silicycle P60级硅胶悬浮在100mL的纯甲醇中，并搅拌48小时。然后将通过硅藻土过滤，（硅藻土事先通过水浆的形式添加到过滤器中，用蒸馏水冲洗5次，然后用甲醇冲洗3次，过滤后的滤饼也用甲醇洗涤3次），浓缩滤液，结果烧瓶壁上确实附着着硅胶，残余物称重得出硅胶量大约4毫克。所以，甲醇是可以部分溶解硅胶的。

硅胶粉末的成分是二氧化硅， 二氧化硅是路易斯酸，甲醇对路易斯酸一般都有溶解度，理论上会溶解二氧化硅。

此外，硅胶上面有硅醇基，可以和甲醇形成氢键，因此硅胶在甲醇里有一定的溶解度。经验发现，一般情况下MeOH/DCM = 10/1还是比较安全的。如果二者的极性达到了MeOH/DCM = 4/1，那么在过柱子时就极有可能冲下来部分硅胶。

甲醇溶硅胶解决办法：

1）先把溶剂旋干，再用不溶解硅胶而溶解产品的溶剂溶解，微孔滤膜或砂芯漏斗过滤，旋干。

2）如果过柱子必须用甲醇的话，先用甲醇洗脱剂将柱子洗脱几次再上样，除去溶于甲醇的一些杂质，装柱时流出的溶剂浑浊慢慢的就看不见了。

3）低浓度的MeOH对硅胶的溶解应该不会是太大，所以DCM/MeOH体系尽量控制在10/1左右，对于极性真的很大的胺可以选择中性氧化铝进行过柱子。