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嘉峪检测网 2025-04-02 08:07
1. 实验步骤
1.1 样本采集和处理
收集新鲜血液样本在4℃条件下离心(如3000~4000 × g,15 min),血浆则位于上层,形成清晰的分层,而血液中的其他细胞成分(如红细胞、白细胞、血小板等)沉淀到离心管底部。
将分离得到的血浆转移到新的无菌离心管中。如果不立即进行外泌体提取,可将血浆样本分装保存在-80℃冰箱中,冻融次数一般不超过2次,否则会降低血浆RNA的提取率。
1.2 外泌体的分离
1.2.1超速离心法(常用方法之一)
将血浆样本在4℃下进行第一次低速离心300 × g,10 min,去除血浆中的细胞碎片。
取上清液进行第二次离心2000 × g,10 min,进一步去除较大的颗粒,如血小板等。
将上清液转移到新的超速离心管中,在4℃,100000 × g,超速离心90 min,使外泌体沉淀在管底。
弃去上清液,保留外泌体沉淀,用RNase-free Water重悬外泌体。
1.2.2 试剂盒法(如基于聚合物沉淀的试剂盒)
根据试剂盒说明书,按比例将适量的沉淀试剂加入血浆样本中,充分混匀。
4℃孵育30 min或者过夜使外泌体沉淀。
1500 × g,离心30 min收集外泌体沉淀,弃去上清液,用Rnase-free Water重悬外泌体。
1.3 外泌体RNA的提取
1. 裂解外泌体
向含有外泌体沉淀的离心管中加入适量的裂解液,充分混匀,使外泌体裂解,释放RNA。
2. RNA提取操作步骤
1)试剂盒法提取
根据所选用的RNA提取试剂盒的具体步骤进行操作。将裂解后的样本转移到吸附柱中,4℃ 12000 × g,离心30 s,使RNA吸附在吸附柱上。
用洗涤液洗涤吸附柱,12000 × g,离心30 s,重复洗涤2次,去除杂质。
最后,向吸附柱中加入60℃预热的Rnase-free Water或洗脱液,静置2 min左右;
4℃ 12000 × g,离心1 min,收集洗脱下来的RNA溶液。
2)TRIZOL提取法
利用相分离的原理,向裂解后的外泌体样本中加入等体积的Trizol试剂,充分混匀。
室温静置5 min,使核酸蛋白复合物充分裂解。
然后,加入氯仿(Trizol体积的1/5),剧烈振荡30 s,室温静置10 min。
之后,4℃ 12000 × g,离心15 min,溶液分为三层,RNA在上层水相中。
将上层水相转移至新的离心管中,加入等体积的异丙醇,冰上沉淀10 min。
4℃ 12000 × g离心10 min收集RNA沉淀。
配置75%浓度的乙醇洗涤RNA沉淀3次,4℃ 7500 × g离心5 min,小心弃去乙醇。在通风橱内干燥5~10 min也可将离心管倒扣在吸水纸上,离心管壁上无明显水滴即可,干燥时间过长可能会导致后续溶解RNA比较困难。
最后,用60~80 μL的RNase-free水或DEPC水溶解RNA,保存至-80℃备用。
2. 注意事项
2.1 样本采集与处理
采集血液样本时,避免溶血,通常使用含乙二胺四乙酸(EDTA)或者枸橼酸钠等抗凝血剂的真空采血管。
因为红细胞破裂会释放出大量的RNA酶,导致外泌体RNA降解。血浆样本在保存和处理过程中要避免反复冻融,每次冻融会导致外泌体的损失和RNA的降解,使用过程需在冰上融化。
2.2 防止RNA降解
整个操作过程要在无RNA酶的环境中进行。
使用经DEPC处理过的耗材(如离心管、枪头)和RNase-free Water。
操作要迅速,样本置于冰盒上,要避免样本长时间暴露在室温下,尤其是在裂解外泌体后,因为RNA酶在室温下活性较高。
2.3 外泌体分离方法的选择与优化
超速离心法虽然是分离外泌体的经典方法,但对设备要求高,操作较为复杂。
如果采用试剂盒法,要根据样本类型和实际情况选择合适的试剂盒,并通过预实验进行优化。
不同的外泌体分离方法可能会对后续RNA提取的质量和产量产生影响,要综合考虑分离效率和RNA完整性。
2.4 RNA提取质量检测
提取得到的RNA要进行质量检测,如通过琼脂糖凝胶电泳观察RNA的完整性,一般能够看到清晰的18S和28S条带,但方法容易导致RNA容易降解,使用的仪器、试剂均需要用DEPC水处理或者配置。
为了便利,通常直接使用Nanodrop微量分光光度计检测RNA的浓度和纯度,OD260/OD280比值应在1.8~2.0之间。
图1琼脂糖凝胶电泳 (created in snappgene)
在正常的RNA琼脂糖凝胶电泳结果中,从加样孔开始,向凝胶的正电极方向,会依次出现28SrRNA、18SrRNA和5SrRNA的条带。
其中,28SrRNA的条带位置在离加样孔较近的地方,18SrRNA条带在28SrRNA条带的下方(即离加样孔稍远的位置),5SrRNA条带则离加样孔最远。
如果RNA质量较好,没有发生降解,28SrRNA条带的亮度应该是18SrRNA条带亮度的约2倍(即28S:18S约为2:1),且两条条带都比较清晰,没有明显的弥散现象。
这表明RNA的完整性良好,没有受到核酸酶等因素的破坏。
2.5 操作规范与安全
在进行超速离心等操作时,要严格按照离心机的操作规范进行,确保仪器安全和操作准确。
操作人员要佩戴手套和口罩,防止样本污染和自身接触有害物质例如Trizol试剂、异丙醇、氯仿或者氯仿替代物等均需要通风橱内操作。
来源:实验老司机